วิธีป้องกันการโดนแฮ็กบัญชีมีหลากหลายวิธี โดยขั้นตอนแรกคุณต้องอัพเดทไลน์ให้เป็นเวอร์ชั่นล่าสุดก่อน โดยสามารถอัพเดทได้จาก Apple Store / Play Store โดยขึ้นอยู่กับระบบปฎิบัติการของโทรศัพท์ของคุณ หรือ Line PC เพียงแค่ต่อกับอินเตอร์เน็ท ระบบก็จะอัพเดทอัตโนมัติ โดยวิธีป้องกันบัญชีของคุณมีดังต่อไปนี้ 
- อย่าให้ผู้อื่นรู้รหัสเด็ดขาด ควรจะตั้งแบบไม่ยากและไม่ง่ายจนเกินไปนัก ควรตงค่ารหัสผ่านให้มีทั้งตัวอักษรและตัวเลขผสมกันไป
- ถ้ามีข้อความแปลกปลอม โดยอ้างว่าเป็นทีมงานของ Line โดยทำการขอรหัสผ่าน อย่าหลงเชื่อ เพราะทีมงานของ Line จะไม่ขอรหัสผ่านจากผู้ใช้ทุกกรณี
- เมื่อมีคนส่งลิงค์แปลกปลอมเข้ามา ควรตรวจเช็คก่อนกดเปิดทุกครั้ง เพื่อป้องกันไวรัส
- Line Official Account ต่างๆ ผู้ใช้ทั่วไปสามารถสร้างเองได้ ถ้าบัญชีไหนมีพิรุธหรือไม่น่าเชื่อถือ ให้รีบรายงานไปทาง Line ทันที
- สำหรับ Line PC ควรลงชื่อออก หลังการใช้งานทุกครั้ง
– สำรองประวัติการแชท
การสำรองประวัติการแชท ก็เป็นสิ่งพื้นฐานที่ผู้ใช้ LINE ควรทำอยู่สม่ำเสมอ เพื่อเก็บข้อมูลแชทต่างๆ ไว้บนแอพพลิเคชันเผื่อไว้ในกรณีที่โทรศัพท์สูญหายหรือเกิดเหตุขัดข้องใดๆ ข้อมูลการแชทก่อนหน้าของเราก็จะถูกเก็บรักษาไว้อย่างดี โดยวิธีก็มีวิธีทั้งสำหรับระบบ iOS และ Android ตามภาพ 
– หากพบการ Log In ที่ไม่ทราบที่มา
หลายครั้งเราใช้ LINE ผ่านบนอุปกรณ์อื่นที่ไม่ใช่มือถือเครื่องหลัก ทำให้เราอาจลืมล็อกเอาท์ หรืออาจถูกขโมยพาสเวิร์ดไปล็อกอินในอุปกรณ์อื่นๆ หากพบว่ามีการล็อกอินโดยไม่ทราบที่มา เราเองก็สามารถตั้งค่าปิดการอนุญาตให้เข้าสู่ระบบบนเครื่องอื่นได้ทันที อุปกรณ์อื่นที่ล็อกอินอยู่นั้นก็จะล็อกเอาท์ในทันทีเช่นกัน
– แจ้งทุกปัญหาการใช้งานของLINE
หากผู้ใช้พบความผิดปกติหรือปัญหาจากการใช้งานจาก Line สามารถแจ้งได้ที่นี่ โดยต้องลงชื่อใช้งานก่อน กรณีหากบัญชีโดนแฮ็ก สามารถเลือกดำเนินการโดยไม่ต้องล็อกอิน (Continue without logging in) เมื่อรายงานปัญหาเสร็จ จะได้รับเลขที่รับแจ้ง ไว้สำหรับการดำเนินการและติดตามผล